Caractérisation du microbiome chez les patients atteints d'insuffisance rénale terminale

Abstract

L'insuffisance rénale terminale (IRT) est la phase finale de la maladie rénale chronique (MRC) où les reins cessent de fonctionner de manière adéquate pour filtrer les déchets et l'excès de liquide du sang. Les patients atteint d`IRT présentent souvent une dysbiose intestinale, caractérisée par une réduction de la diversité microbienne. Cette dernière est liée à l'accumulation de toxines urémiques, à des régimes alimentaires restrictifs, à l'usage d'antibiotiques et à des changements dans le transit intestinal. Dans le but d`étudier les caractéristiques de microbiote intestinal chez les patients atteint d`IRT, nous avons réalisé une étude comparative pendant 3 mois de stage au sein de l`établissement privé « Le Rameau d`Olivier ». Notre travail consistait à étudier la flore digestive chez deux groupes de sujet l`un des patients atteints d`IRT et l`autre de personnes saines, basé sur l`identification de la flore bactérienne. Ce travail nous a permis d’identifier et d’isoler les souches présentes dans les selles des deux groupes afin de les comparer. Une relation étroite entre l`IRT et la dysbiose de microbiote intestinal a été observée. Chez le groupe IRT, une dominance des germes isolés était de 50% pour Klebsiella pneumoniae principalement et 38%, 22% des Pasterella pneumotropica et Pleisiomonas shigelloides, 11% cas de Serratia marcescens 11% des Stenotropophomonas. Chez le groupe témoin, Klebsiela pneumoniae ne représentait que 7%, d’autre part, des espèces autres ont été rapportées, comme Pseudomonas fluorescence et Straphylococcus epedermidis.