Thèses de doctorat

Potentiel probiotique de souches de Lactobacillus et de Pediococcus isolées de fientes de poulet de chair:étude in vitro

Wed, 23 Feb 2022 00:00:00 GMT

Potentiel probiotique de souches de Lactobacillus et de Pediococcus isolées de fientes de poulet de chair:étude in vitro Benbara, Tassadit; Bendali, Farida ( Rapporteur ) Au cours de cette étude, une enquête a été réalisée dans le but de connaitre les conditions d’élevage. Les résultats montrent un élevage traditionnel avec la dominance des souches Isabrown 15 et la Cob et une utilisation des antibiotiques à titre préventif. L’étude de la flore intestinale montre la richesse de cette flore en lactobacilles (108 à 109 UFC/g) et en levures (106 à 108 UFC/g). Un isolement de souches de Lactobacillus et de Pediococcus a été réalisé à partir des fientes de poulets de chair et plusieurs tests in vitro ont été réalisés dans le but de mettre en évidence leurs effets probiotiques. Ces souches ont été testées pour leur activité antibactérienne vis-à-vis de certaines souches pathogènes (E. coli ATCC25922, Salmonella enterica CIP 81-3, S. aureus ATCC25923 et L. innocua CIP 74915) dont on a trouvé une bonne activité antibactérienne (10 à 24 mm de diamètre), évaluées quant à leur résistance à l’acidité (une très bonne résistance aux pH 2 ; 2.5 et 3) et à la bile (0.1 ; 0.3 et 0.5%) ainsi que leur capacité d’adhésion sur cellules épithéliales de poulet. A travers les résultats des tests de criblage, une souche de Lactobacillus (S27) a été sélectionnée pour l’étude in vivo. Des tests in vivo ont été réalisés sur des poussins pour étudier l’efficacité de la souche sélectionnée sur les paramètres zootechniques. Les résultats montrent que les poids moyens obtenus à la fin d’élevage (après 60 jours) ont été respectivement de 3246±356,99 g chez les poulets du lot test (lot 3), 2977±234,45 g chez ceux du lot 2 (TEM) et 2978±194,46 g chez ceux du lot 1 (ATB). Les gains moyens quotidiens de poids des poussins ont également été calculés, les résultats montrent des variations significatives (P<0,05) du gain moyen quotidien de poids tout au long de la période d’élevage. L’analyse histologique n’a montré aucun effet de cette souche (S27) sur les trois segments de l’intestin de poulet de chair (duodénum, jéjunum et iléon) ce qui confirme la non-toxicité de la souche. A travers l’ensemble des résultats de cette étude, cette souche peut être utilisée comme probiotique en alimentation de poulet de chair pour remplacer les antibiotiques dans le but d’améliorer la croissance de poulet et de lutter contre le phénomène de la résistance aux antibiotiques. Option : Microbiologie

Isolement de bactéries à partir des milieux aquatiques productrices des substances antifongiques

Tue, 26 Jun 2018 00:00:00 GMT

Isolement de bactéries à partir des milieux aquatiques productrices des substances antifongiques Tabli-Cherifi, Nassira; Nabti, El-Hafid ( Rapporteur ) Option : Microbiologie Appliquée

Identification de microorganismes à caractère antagoniste :Détermination des métabolites impliqués

Tue, 01 Jan 2019 00:00:00 GMT

Identification de microorganismes à caractère antagoniste :Détermination des métabolites impliqués Benslim, Asma; Mezaache, Samia ( Rapporteur ) Les 45 isolats utilisés dans ce travail proviennent des rhizosphères du blé et de la pomme de terre près de la région de Sétif. Ils ont été présélectionnés à la base de leur pouvoir inhibiteur de la croissance de champignons phytopathogènes telluriques. Le séquençage du gène de l’ADNr 16S, a montré que les souches appartenaient majoritairement aux genres Bacillus et Pseudomonas. Sur les quatre souches évaluées pour leur capacité à induire l’expression des gènes de défense chez Arabidopsis, Bacillus amyloliquefaciens A16 et Pseudomonas plecoglossicida XI39 ont montré une induction de l’expression des gènes à des taux aussi important que ceux obtenus avec l’acide salicylique. La production de ce dernier a été mise en évidence pour ces quatre souches, elles ont produit des concentrations comprises entre 0.31 et 0.4 mg/ml. 24 isolats à Grampositif ayant le meilleur potentiel antifongique in vitro ont été sélectionnés pour le criblage de quatre gènes de biosynthèses des lipopeptides cycliques et pour la production de composés organiques volatils antifongiques. Le profil électrophorétique des produits de PCR a montré l’abondance du gène de biosynthèse de la fengycine (70.33%) ; suivi par ceux de la surfactine (66.66%), la bacillomycine (58.33%) et la mycosubtiline (25%). Les composés volatils émis par ces isolats ont montré une inhibition considérable de la croissance de Phytophtora infestans, étant moins actifs contre Fusarium oxysporum var. coeruleum, tandis que F. oxysporum f. sp. albedinis et F. graminearum ont été résistants. Les Gram-positifs ont formé des biofilms plus denses que ceux formés par les Gram-négatifs. Aussi, l’effet biorémidiateur des isolats a été évalué en testant leur capacité à dégrader les fongicides, où la souche Pseudomonas protegens XI14 a dégradé les trois fongicides : propicone, curatine V et kazir. Certains isolats ont significativement stimulé la croissance du blé durant la phase de la levée, à savoir : P. protegens XI14, P. plecoglossicida 29INH et B. amyloquefaciens 30INH. Les Gram-négatifs ont été plus efficaces en protégeant le blé contre F. graminearum. Aucun déclin n’a été enregistré chez les plantules traitées avec P. protegens XI11 et Pseudomonas sp. (XI3 et P37). Quant aux souches pathogènes identifiées : Acinetobacter calcoaceticus XI22, Hafnia alvei XI47 et Stenotrophomonas maltophilia P29 ; ces isolats ont eu un potentiel antagoniste très considérable en confrontation directe contre des champignons pathogènes résistants aux fongicides mais très restreint en confrontation indirecte par production de substances volatiles. P29 a produit des lipases et des protéases alors que XI47 n’a produit que des lipases. Option : Microbiologie

Prévalence et résistance aux antibiotiques de souches de bacilles à Gram négatif isolés à partir des fruits et légumes

Sat, 29 Oct 2022 00:00:00 GMT

Prévalence et résistance aux antibiotiques de souches de bacilles à Gram négatif isolés à partir des fruits et légumes Touati, Abdelaziz ( Directeur de thèse ); Mesbah Zekar, Ferielle Le rôle des aliments dans l’exposition humaine à des bactéries résistantes aux antibiotiques est un problème de sécurité alimentaire important. L’objectif principal de notre étude était l’évaluation de la contamination des fruits et légumes par des bacilles à Gram négatif résistants aux céphalosporines de troisième génération, et la caractérisation phénotypique et moléculaire des mécanismes de résistance aux antibiotiques chez ces bacilles à Gram négatif. Un total de 491 échantillons de fruits et légumes issus de 5 marchés et 7 fermes maraichères de Bejaia, côte nord-est de la Méditerranée algérienne, ont été analysés. Un total de 90 échantillons de sol et 45 échantillons d'eau d'irrigation issus de 7 différentes fermes ont été également analysés. L’ensemble des méthodes et techniques réalisées ont permis l’isolement de bacilles à Gram négatif multirésistants aux antibiotiques. Les bactéries isolées dans les fruits et les légumes, le sol et l'eau d'irrigation collectées dans les fermes étaient presque toutes des espèces bactériennes non fermentaires. Une plus grande diversité d'espèces bactériennes et de profils de résistance aux antimicrobiens a été observée sur les marchés ; les Enterobacteriaceae étaient aussi fortement représentées que les bactéries non fermentaires. Parmi les Enterobacteriaceae, les isolats de K. pneumoniae étaient des producteurs de bêtalactamase à spectre étendu (BLSE). Le séquençage du génome entier a permis l’identification de blaCTXM-15 dans 11 souches de BLSE et blaDHA dans deux pAmpC. Le gène aac(6’)Ib-cr a été identifié dans 8/13 souches de Klebsiella pneumoniae. Les clones détectés sont de cinq types : ST14, ST45, ST219, ST236 et le ST882. Cette étude a montré que les fruits et légumes peuvent constituer un réservoir de bactéries à Gram négatif multi-résistantes, qui peuvent être transférées à l'homme par la nourriture, ce qui peut représenter une menace sous-estimée pour la santé publique. Cette étude souligne que les mesures d'hygiène lors de la récolte et de la vente sont d'une importance capitale pour limiter la propagation de bactéries multirésistantes aux consommateurs. Option : Microbiologie Appliquée