Caractérisation des phénotypes de résistance aux antibiotiques des souches de bacilles à Gram négatif isolées dans quelques hôpitaux du Yémen.

Abstract

L’objectif de notre travail est la détermination des phénotypes de résistance aux β-lactamines, en particulier aux carbapénèmes chez des souches d’entérobactéries. Des souches d’entérobactéries résistantes au céfotaxime et /ou au céftazidime ont été collectées au niveau de deux hôpitaux et de quatre laboratoires d’analyses médicales de la région de Sana’a (Yémen) durant une période de 4 mois (de Décembre 2012 à Avril 2013). La sensibilité de ces souches d’entérobactéries aux carbapénèmes a été réalisée par la méthode de l’antibiogramme et par la détermination des CMI (E-Test). Les phénotypes de résistance aux béta-lactamines ont été déterminés par le DD-Test, le test de Hodge et le test à l’EDTA. La caractérisation moléculaire de la résistance aux carbapénèmes et de la résistance associée a été effectuée par PCR et séquençage des gènes blaNDM-1, blaCTXM-15, blaTEM-1 et qnr. La détermination de la clonalité des souches a été réalisée par RAPD et enfin, un essai de transfert par conjugaison des gènes de résistance aux antibiotiques a été effectué pour trois souches. Au total, 178 souches d’entérobactéries ont été collectées. Parmi lesquelles, 82% (146/178) sont des E. coli et 13% (23/178) sont des K. pneumoniae. De plus, 41% (73/178) sont d’origine hospitalière et 59% (10 5/178) sont d’origine communautaire. Dix souches d’entérobactéries (soit 5,6%) ont été résistantes aux carbapénèmes dont 8 souches de K. pneumoniae et 2 souches de E. cloacae. Ces souches multirésistantes sont productrices de carbapénémases de type NDM-1 associées à la production de BLSE de type CTX-M-15 et/ou TEM-1 et 9 souches étaient Qnr positives (5 QnrB1, 2 QnrA et 2 QnrS1). La RAPD a permis de constater une diversité génétique parmi les souches productrices de NDM-1. Cette étude décrit pour la première fois la dissémination de BLSE et de NDM-1 parmi des souches de d’entérobactéries isolées au Yémen.